Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD1Q9ULT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD1Q9ULT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD1Q9ULT8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms