Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TSKSQ9UJT2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSKSQ9UJT2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSKSQ9UJT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSKSQ9UJT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms