Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPAR3Q9UBY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPAR3Q9UBY5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPAR3Q9UBY5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPAR3Q9UBY5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms