Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU3

GHRL, Appetite-regulating hormone, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHRLQ9UBU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GHRLQ9UBU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GHRLQ9UBU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GHRLQ9UBU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GHRLQ9UBU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms