Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10DQ9UBN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF10DQ9UBN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms