Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDP1Q9P0J1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDP1Q9P0J1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP1Q9P0J1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms