Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF4Q9P032 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF4Q9P032 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF4Q9P032 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms