Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSRB1Q9NZV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSRB1Q9NZV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSRB1Q9NZV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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