Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
PDS5BQ9NTI5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
PDS5BQ9NTI5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PDS5BQ9NTI5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC43.76■■■■■ 4.6
PDS5BQ9NTI5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PDS5BQ9NTI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
PDS5BQ9NTI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms