Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB9Q9NP78 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB9Q9NP78 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms