Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCQ9H7C4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNCQ9H7C4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCQ9H7C4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCQ9H7C4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms