Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCXQ9H320 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCXQ9H320 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCXQ9H320 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCXQ9H320 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCXQ9H320 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms