Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 216.94■□□□□ 0.38e-9■■■■■ 31.6
CSTF2TQ9H0L4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 31.6
CSTF2TQ9H0L4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 31.6
CSTF2TQ9H0L4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 31.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 314.32□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 319.45■□□□□ 0.71e-11■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 317.88■□□□□ 0.451e-11■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 513.7□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 56.46□□□□□ -1.381e-11■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 36.37□□□□□ -1.391e-11■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-207ENST00000610559 542 ntTSL 410.54□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 47.81□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 37.81□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-205ENST00000480592 1001 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 31.5
CSTF2TQ9H0L4 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 210.48□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 316.91■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 514.46□□□□□ -0.091e-10■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 222.72■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 222.55■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.982e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)4.5□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 31.4
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 217.37■□□□□ 0.371e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 520.07■□□□□ 0.87e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 411.82□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-9■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 214.86□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.97□□□□□ -1.612e-10■■■■■ 31.3
CSTF2TQ9H0L4 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 27.61□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 31.2
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 215.78■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 313.61□□□□□ -0.235e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 213.28□□□□□ -0.285e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 510.24□□□□□ -0.775e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 210.09□□□□□ -0.795e-10■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)18.88■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR43-203ENST00000434238 386 ntTSL 318.73■□□□□ 0.599e-9■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 46.15□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.45□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 414.16□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 31.1
CSTF2TQ9H0L4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.649e-9■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.49e-9■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 DGCR6L-203ENST00000443409 935 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.069e-9■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-13■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 NAB1-207ENST00000426601 545 ntTSL 415.09■□□□□ 0.013e-13■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 NAB1-209ENST00000448811 590 ntTSL 410.34□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 NAB1-204ENST00000416973 568 ntTSL 49.85□□□□□ -0.833e-13■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 58.53□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 55.69□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 31
CSTF2TQ9H0L4 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 523.41■■□□□ 1.344e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 321.33■■□□□ 1.014e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.934e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 520.79■□□□□ 0.924e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 520.26■□□□□ 0.834e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 519.87■□□□□ 0.774e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 319.65■□□□□ 0.744e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 519.65■□□□□ 0.744e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.134e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 48.81□□□□□ -14e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.583e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 210.77□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 30.9
CSTF2TQ9H0L4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.316e-10■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.675e-10■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.489e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 516.86■□□□□ 0.299e-9■■■■■ 30.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 216.78■□□□□ 0.289e-9■■■■■ 30.8
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