RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434238.1

WDR43-203, Transcript of WD repeat domain 43, humanhuman

TSL 3

Gene WDR43, Length 386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43-203ENST00000434238 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.4■■■■■ 5.5
WDR43-203ENST00000434238 ABCC9O60706 1549 aa44.36■■■■■ 4.69
WDR43-203ENST00000434238 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.25■■■■■ 4.67
WDR43-203ENST00000434238 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.18■■■■■ 4.34
WDR43-203ENST00000434238 NACADO15069 1562 aa41.89■■■■■ 4.3
WDR43-203ENST00000434238 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.81■■■■■ 4.28
WDR43-203ENST00000434238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.65■■■■■ 4.26
WDR43-203ENST00000434238 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
WDR43-203ENST00000434238 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
WDR43-203ENST00000434238 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.14■■■■■ 4.18
WDR43-203ENST00000434238 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.95■■■■■ 4.15
WDR43-203ENST00000434238 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
WDR43-203ENST00000434238 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.78■■■■■ 4.12
WDR43-203ENST00000434238 SCRIBQ14160 1630 aa40.39■■■■■ 4.06
WDR43-203ENST00000434238 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
WDR43-203ENST00000434238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.02■■■■■ 4
WDR43-203ENST00000434238 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.96■■■■□ 3.99
WDR43-203ENST00000434238 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
WDR43-203ENST00000434238 NCAPD3P42695 1498 aa38.71■■■■□ 3.79
WDR43-203ENST00000434238 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.6■■■■□ 3.77
WDR43-203ENST00000434238 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
WDR43-203ENST00000434238 SMARCA2P51531 1590 aa38.45■■■■□ 3.75
WDR43-203ENST00000434238 HMGXB3Q12766 1538 aa38.38■■■■□ 3.73
WDR43-203ENST00000434238 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
WDR43-203ENST00000434238 ERCC6Q03468 1493 aa38.3■■■■□ 3.72
WDR43-203ENST00000434238 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.23■■■■□ 3.71
WDR43-203ENST00000434238 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
WDR43-203ENST00000434238 CUX2O14529 1486 aa38.2■■■■□ 3.71
WDR43-203ENST00000434238 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.13■■■■□ 3.69
WDR43-203ENST00000434238 NESP48681 1621 aa38.11■■■■□ 3.69
WDR43-203ENST00000434238 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
WDR43-203ENST00000434238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.79■■■■□ 3.64
WDR43-203ENST00000434238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
WDR43-203ENST00000434238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.62■■■■□ 3.61
WDR43-203ENST00000434238 WIZO95785 1651 aa37.6■■■■□ 3.61
WDR43-203ENST00000434238 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.55■■■■□ 3.6
WDR43-203ENST00000434238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.53■■■■□ 3.6
WDR43-203ENST00000434238 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
WDR43-203ENST00000434238 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.28■■■■□ 3.56
WDR43-203ENST00000434238 WDR62O43379 1518 aa37.17■■■■□ 3.54
WDR43-203ENST00000434238 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.13■■■■□ 3.54
WDR43-203ENST00000434238 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
WDR43-203ENST00000434238 CFTRP13569 1480 aa37.11■■■■□ 3.53
WDR43-203ENST00000434238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.11■■■■□ 3.53
WDR43-203ENST00000434238 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
WDR43-203ENST00000434238 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.75■■■■□ 3.47
WDR43-203ENST00000434238 PRDM2Q13029 1718 aa36.6■■■■□ 3.45
WDR43-203ENST00000434238 TRIM41Q8WV44 630 aa36.58■■■■□ 3.45
WDR43-203ENST00000434238 OSCARQ8IYS5 282 aa36.52■■■■□ 3.44
WDR43-203ENST00000434238 IFT140Q96RY7 1462 aa36.41■■■■□ 3.42
WDR43-203ENST00000434238 TOPBP1Q92547 1522 aa36.4■■■■□ 3.42
WDR43-203ENST00000434238 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
WDR43-203ENST00000434238 ABCC8Q09428 1581 aa36.31■■■■□ 3.4
WDR43-203ENST00000434238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.24■■■■□ 3.39
WDR43-203ENST00000434238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
WDR43-203ENST00000434238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
WDR43-203ENST00000434238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
WDR43-203ENST00000434238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
WDR43-203ENST00000434238 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
WDR43-203ENST00000434238 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
WDR43-203ENST00000434238 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
WDR43-203ENST00000434238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.92■■■■□ 3.34
WDR43-203ENST00000434238 SOGA1O94964 1423 aa35.9■■■■□ 3.34
WDR43-203ENST00000434238 ARHGEF11O15085 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
WDR43-203ENST00000434238 FBLN2P98095 1184 aa35.85■■■■□ 3.33
WDR43-203ENST00000434238 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
WDR43-203ENST00000434238 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.81■■■■□ 3.32
WDR43-203ENST00000434238 CHD1O14646 1710 aa35.8■■■■□ 3.32
WDR43-203ENST00000434238 CUX1P39880 1505 aa35.77■■■■□ 3.32
WDR43-203ENST00000434238 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
WDR43-203ENST00000434238 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.68■■■■□ 3.3
WDR43-203ENST00000434238 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.66■■■■□ 3.3
WDR43-203ENST00000434238 WDR97A6NE52 1622 aa35.65■■■■□ 3.3
WDR43-203ENST00000434238 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
WDR43-203ENST00000434238 GRIN2BQ13224 1484 aa35.56■■■■□ 3.28
WDR43-203ENST00000434238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
WDR43-203ENST00000434238 ARAP1Q96P48 1450 aa35.54■■■■□ 3.28
WDR43-203ENST00000434238 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.44■■■■□ 3.26
WDR43-203ENST00000434238 SYNJ2O15056 1496 aa35.44■■■■□ 3.26
WDR43-203ENST00000434238 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.44■■■■□ 3.26
WDR43-203ENST00000434238 SYNJ1O43426 1573 aa35.42■■■■□ 3.26
WDR43-203ENST00000434238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.4■■■■□ 3.26
WDR43-203ENST00000434238 PBRM1Q86U86 1689 aa35.33■■■■□ 3.25
WDR43-203ENST00000434238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.31■■■■□ 3.24
WDR43-203ENST00000434238 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
WDR43-203ENST00000434238 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
WDR43-203ENST00000434238 TOP2BQ02880 1626 aa35.17■■■■□ 3.22
WDR43-203ENST00000434238 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.15■■■■□ 3.22
WDR43-203ENST00000434238 GRIN2AQ12879 1464 aa35.1■■■■□ 3.21
WDR43-203ENST00000434238 ADAMTS12P58397 1594 aa35.04■■■■□ 3.2
WDR43-203ENST00000434238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35■■■■□ 3.19
WDR43-203ENST00000434238 NUP160Q12769 1436 aa34.98■■■■□ 3.19
WDR43-203ENST00000434238 CEP170Q5SW79 1584 aa34.96■■■■□ 3.19
WDR43-203ENST00000434238 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.94■■■■□ 3.18
WDR43-203ENST00000434238 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.91■■■■□ 3.18
WDR43-203ENST00000434238 SHROOM2Q13796 1616 aa34.78■■■■□ 3.16
WDR43-203ENST00000434238 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
WDR43-203ENST00000434238 JPH4Q96JJ6 628 aa34.68■■■■□ 3.14
WDR43-203ENST00000434238 IGF1RP08069 1367 aa34.55■■■■□ 3.12
WDR43-203ENST00000434238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms