Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPL3Q9BY60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms