Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRA6Q9BX79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRA6Q9BX79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRA6Q9BX79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms