Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JAM3Q9BX67 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JAM3Q9BX67 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JAM3Q9BX67 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms