Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX2Q99697 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX2Q99697 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITX2Q99697 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms