Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDRT15Q96T59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDRT15Q96T59 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDRT15Q96T59 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDRT15Q96T59 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDRT15Q96T59 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms