Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RILPQ96NA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RILPQ96NA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RILPQ96NA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RILPQ96NA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms