Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM3Q96MX0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM3Q96MX0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM3Q96MX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms