Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL15Q96M94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL15Q96M94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL15Q96M94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL15Q96M94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms