Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC7Q96M83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC7Q96M83 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC7Q96M83 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC7Q96M83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms