Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1Q96KN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPGRIP1Q96KN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPGRIP1Q96KN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms