Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERAC1Q96JX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERAC1Q96JX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms