Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAGED4Q96JG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGED4Q96JG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGED4Q96JG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms