Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS50Q96JG6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS50Q96JG6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS50Q96JG6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms