Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEC22AQ96IW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SEC22AQ96IW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC22AQ96IW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22AQ96IW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms