Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53INP1Q96A56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP53INP1Q96A56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TP53INP1Q96A56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TP53INP1Q96A56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms