Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFRSF25Q93038 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNFRSF25Q93038 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNFRSF25Q93038 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms