Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP9XQ93008 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP9XQ93008 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP9XQ93008 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP9XQ93008 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms