Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DPF3Q92784 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPF3Q92784 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DPF3Q92784 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPF3Q92784 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms