Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRUQ92729 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRUQ92729 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRUQ92729 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRUQ92729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms