Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms