Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM13CQ8NE31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13CQ8NE31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM13CQ8NE31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM13CQ8NE31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms