Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11CQ8NB49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP11CQ8NB49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP11CQ8NB49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms