Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NANOGP1Q8N7R0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP1Q8N7R0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP1Q8N7R0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGP1Q8N7R0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms