Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVOPQ8N4V2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVOPQ8N4V2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVOPQ8N4V2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVOPQ8N4V2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms