Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PQLC1Q8N2U9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PQLC1Q8N2U9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PQLC1Q8N2U9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms