Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARM1Q86X55 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARM1Q86X55 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CARM1Q86X55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARM1Q86X55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms