Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC80Q76M96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC80Q76M96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC80Q76M96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC80Q76M96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.1 ms