Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP34Q70CQ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
USP34Q70CQ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP34Q70CQ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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