Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM43Q6ZSC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBM43Q6ZSC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM43Q6ZSC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms