Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD2Q6Y1H2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD2Q6Y1H2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD2Q6Y1H2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms