Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SARM1Q6SZW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SARM1Q6SZW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SARM1Q6SZW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms