Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM88Q6PEY1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM88Q6PEY1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM88Q6PEY1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms