Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAAP20Q6NZ36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAAP20Q6NZ36 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAAP20Q6NZ36 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAAP20Q6NZ36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms