Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN12Q6JVE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN12Q6JVE5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCN12Q6JVE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms