Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGNBP1Q5YKI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GGNBP1Q5YKI7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGNBP1Q5YKI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GGNBP1Q5YKI7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.6 ms