Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
CHIC1Q5VXU3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CHIC1Q5VXU3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CHIC1Q5VXU3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CHIC1Q5VXU3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms